Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF103O00237 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF103O00237 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF103O00237 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF103O00237 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF103O00237 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF103O00237 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF103O00237 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF103O00237 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF103O00237 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF103O00237 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF103O00237 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF103O00237 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF103O00237 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF103O00237 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF103O00237 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF103O00237 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF103O00237 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF103O00237 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF103O00237 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF103O00237 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF103O00237 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF103O00237 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF103O00237 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF103O00237 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF103O00237 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF103O00237 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF103O00237 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF103O00237 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF103O00237 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF103O00237 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RNF103O00237 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF103O00237 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF103O00237 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF103O00237 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF103O00237 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF103O00237 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF103O00237 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF103O00237 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF103O00237 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF103O00237 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF103O00237 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF103O00237 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF103O00237 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF103O00237 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF103O00237 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF103O00237 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF103O00237 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF103O00237 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF103O00237 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF103O00237 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF103O00237 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF103O00237 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF103O00237 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF103O00237 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF103O00237 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF103O00237 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF103O00237 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF103O00237 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF103O00237 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF103O00237 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF103O00237 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF103O00237 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF103O00237 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF103O00237 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF103O00237 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF103O00237 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF103O00237 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF103O00237 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms