Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF10AO00220 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF10AO00220 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF10AO00220 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF10AO00220 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFRSF10AO00220 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF10AO00220 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF10AO00220 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFRSF10AO00220 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms