Protein–RNA interactions for Protein: H0Y858

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0Y858 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H0Y858 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H0Y858 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H0Y858 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H0Y858 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H0Y858 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H0Y858 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H0Y858 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H0Y858 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H0Y858 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H0Y858 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H0Y858 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H0Y858 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H0Y858 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H0Y858 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H0Y858 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H0Y858 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H0Y858 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H0Y858 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H0Y858 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H0Y858 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H0Y858 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H0Y858 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H0Y858 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H0Y858 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H0Y858 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H0Y858 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H0Y858 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H0Y858 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H0Y858 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H0Y858 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H0Y858 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H0Y858 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
H0Y858 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H0Y858 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H0Y858 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H0Y858 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H0Y858 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H0Y858 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H0Y858 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H0Y858 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H0Y858 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H0Y858 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H0Y858 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H0Y858 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H0Y858 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H0Y858 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
H0Y858 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
H0Y858 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H0Y858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H0Y858 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H0Y858 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H0Y858 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H0Y858 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H0Y858 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H0Y858 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H0Y858 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H0Y858 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H0Y858 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H0Y858 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H0Y858 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H0Y858 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H0Y858 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H0Y858 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H0Y858 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H0Y858 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H0Y858 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
H0Y858 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H0Y858 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H0Y858 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H0Y858 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
H0Y858 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H0Y858 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms