Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F8W8V4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F8W8V4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F8W8V4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
F8W8V4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F8W8V4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F8W8V4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8W8V4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8W8V4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8W8V4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8W8V4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8W8V4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
F8W8V4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F8W8V4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F8W8V4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8W8V4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F8W8V4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F8W8V4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8W8V4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8W8V4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8W8V4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
F8W8V4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
F8W8V4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
F8W8V4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
F8W8V4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
F8W8V4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
F8W8V4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
F8W8V4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
F8W8V4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
F8W8V4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
F8W8V4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
F8W8V4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F8W8V4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F8W8V4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8W8V4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
F8W8V4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
F8W8V4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8W8V4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8W8V4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8W8V4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
F8W8V4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8W8V4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8W8V4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F8W8V4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F8W8V4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F8W8V4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F8W8V4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
F8W8V4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F8W8V4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
F8W8V4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F8W8V4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
F8W8V4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8W8V4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8W8V4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8W8V4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8W8V4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F8W8V4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8W8V4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8W8V4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8W8V4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8W8V4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8W8V4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F8W8V4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
F8W8V4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F8W8V4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F8W8V4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F8W8V4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F8W8V4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F8W8V4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F8W8V4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
F8W8V4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
F8W8V4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F8W8V4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8W8V4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8W8V4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8W8V4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F8W8V4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
F8W8V4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
F8W8V4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
F8W8V4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8W8V4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8W8V4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
F8W8V4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8W8V4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8W8V4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F8W8V4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8W8V4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8W8V4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F8W8V4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8W8V4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F8W8V4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
F8W8V4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
F8W8V4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
F8W8V4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8W8V4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8W8V4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8W8V4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8W8V4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8W8V4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8W8V4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms