Protein–RNA interactions for Protein: F5H4A9

C3orf80, Uncharacterized membrane protein C3orf80, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf80F5H4A9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf80F5H4A9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C3orf80F5H4A9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf80F5H4A9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf80F5H4A9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf80F5H4A9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf80F5H4A9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf80F5H4A9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf80F5H4A9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf80F5H4A9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms