Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms