Protein–RNA interactions for Protein: E7ERA6

RNF223, RING finger protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF223E7ERA6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF223E7ERA6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF223E7ERA6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF223E7ERA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF223E7ERA6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms