Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C9IYK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C9IYK1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
C9IYK1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C9IYK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9IYK1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C9IYK1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C9IYK1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
C9IYK1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9IYK1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9IYK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9IYK1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9IYK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9IYK1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9IYK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9IYK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9IYK1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9IYK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
C9IYK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9IYK1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9IYK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9IYK1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9IYK1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C9IYK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
C9IYK1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C9IYK1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C9IYK1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C9IYK1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C9IYK1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C9IYK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C9IYK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9IYK1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9IYK1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9IYK1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C9IYK1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9IYK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9IYK1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9IYK1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9IYK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9IYK1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9IYK1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9IYK1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9IYK1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9IYK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9IYK1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9IYK1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9IYK1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9IYK1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9IYK1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9IYK1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9IYK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9IYK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9IYK1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9IYK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9IYK1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9IYK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9IYK1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9IYK1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9IYK1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9IYK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9IYK1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9IYK1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9IYK1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C9IYK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9IYK1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9IYK1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9IYK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C9IYK1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9IYK1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9IYK1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9IYK1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9IYK1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9IYK1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9IYK1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9IYK1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9IYK1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9IYK1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9IYK1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C9IYK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms