Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF879B4DU55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF879B4DU55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF879B4DU55 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF879B4DU55 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms