Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOTOA8MTQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTOA8MTQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTOA8MTQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTOA8MTQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms