Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYSRT1A8MQ03 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYSRT1A8MQ03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYSRT1A8MQ03 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYSRT1A8MQ03 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYSRT1A8MQ03 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms