Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4orf47A7E2U8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf47A7E2U8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C4orf47A7E2U8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C4orf47A7E2U8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4orf47A7E2U8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4orf47A7E2U8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms