Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf92A6NGG3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf92A6NGG3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf92A6NGG3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms