Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TCAF2A6NFQ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCAF2A6NFQ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCAF2A6NFQ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCAF2A6NFQ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCAF2A6NFQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TCAF2A6NFQ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms