Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE3

EFCAB10, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB10A6NFE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB10A6NFE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB10A6NFE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB10A6NFE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFCAB10A6NFE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB10A6NFE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCAB10A6NFE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms