Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM247A6NEH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM247A6NEH6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM247A6NEH6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM247A6NEH6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM247A6NEH6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM247A6NEH6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms