Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC13A5PLN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC13A5PLN9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC13A5PLN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC13A5PLN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms