Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRBA1A5PL33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRBA1A5PL33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRBA1A5PL33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRBA1A5PL33 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRBA1A5PL33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRBA1A5PL33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms