Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTAGE9A4FU28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTAGE9A4FU28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTAGE9A4FU28 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE9A4FU28 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTAGE9A4FU28 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms