Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms