Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3PXD2BA1X283 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3PXD2BA1X283 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3PXD2BA1X283 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3PXD2BA1X283 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms