Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVZ2

FAM240B, Protein FAM240B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM240BA0A1B0GVZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM240BA0A1B0GVZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM240BA0A1B0GVZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM240BA0A1B0GVZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM240BA0A1B0GVZ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM240BA0A1B0GVZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM240BA0A1B0GVZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms