Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAV27A0A087WT01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAV27A0A087WT01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAV27A0A087WT01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms