Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6X5

TRAV18, T-cell receptor alpha variable 18 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV18A0A075B6X5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAV18A0A075B6X5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV18A0A075B6X5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV18A0A075B6X5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms