Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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