Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms