Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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SNX13Q9Y5W8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SNX13Q9Y5W8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SNX13Q9Y5W8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SNX13Q9Y5W8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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