Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms