Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms