Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNRC6BQ9UPQ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms