Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD1Q9UP38 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD1Q9UP38 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms