Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKLN1Q9UL63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKLN1Q9UL63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms