Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms