Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms