Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms