Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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