Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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