Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER2Q9NSB8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms