Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP3Q9NS15 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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