Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BIN3Q9NQY0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms