Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms