Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF3Q9H4W6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF3Q9H4W6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms