Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF39Q9H2S5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF39Q9H2S5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms