Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMX4Q9H1E5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX4Q9H1E5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms