Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms