Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms