Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms