Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms