Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM175Q9BSA9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM175Q9BSA9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms