Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms